1949年10月24日晚，第三野战军第十兵团28军抽调三个团的兵力进行渡海登岛作战，9000多名解放军官兵对金门岛发动进攻。但是这场战役和叶飞事先想的并不一样，最后登岛官兵几乎全军覆没，这也是解放战争期间少有的一次严重失利。
金门战役发生时，当时新中国已经成立，全国大多数省份已经解放，但部队中却出现了严重的轻敌思想，认为国民党军不堪一击，而解放军以陆军起家，对渡海登岛作战并不擅长，所以这次失利的发生是有一定必然性的。但是金门战役的失败是有可能避免的，因为在战前，第十兵团的多名高级将领并不赞同打这场仗。
金门战役开始之前，28军副军长萧锋得到了兵团情报处的情报，情报上说胡琏的两个团在紧急登陆金门岛，而这份情报却漏掉了已经登陆的13师和14师。虽然情报上给出的国军增援部队并不过，但是却引起了等岛部队官兵的高度注意，28军副军长萧锋也察觉到了异样，立刻向兵团司令部请示，但是叶飞显然有点不耐烦了，没有接听。此后，萧锋又连续多次请求停止这次登岛作战，但是都遭到了拒绝。
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和萧锋一样，兵团司令韦国清也察觉到这次作战行动的异样，因为登岛的船只实在是太少了，而且很多渔民不愿意帮忙，实际运输能力大打折扣，而且当时解放军没有海军，登岛部队缺乏火力掩护。还有一点原因，那就是部队始终没有获得岛上国民党军的具体数量，使这次作战结果变得不可预测，叶飞对韦国清说此战必胜，不必多虑。
金门登岛作战进行了三天后，28军副军长萧锋和政治部主任李曼村跑到叶飞面前失声痛哭。此战后，叶飞，萧锋等人受到了处分。叶飞后来一直想要找机会收复金门，但是由于国际形势的变化，一直没有机会。
