第二,如果说洪秀全不掌朝政,应该是指他与杨秀清之间矛盾所引发的事情。在太平天国创立初期,杨秀清为了维护洪秀全的权威,创立了“天父下凡”的闹剧,洪秀全对此大加赞赏,也金口玉言地进行了认可。结果,造成了杨秀清尾大不掉。特别是在定都天京以后,随着形势的好转,杨秀清利欲熏心,通过自导自演“天父下凡”来与洪秀全争权夺势、排除异己,甚至对洪秀全本身安全都构成了直接的威胁。洪秀全不得不一再忍让,而且将军国大事都交由杨秀清裁决。
第三,虽然太平天国的朝政曾一度被杨秀清把持,但实际上持续时间不长。太平天国1853年定都天京后,杨秀清就一直在指挥太平军东征西讨,取得了军事上的节节胜利,到1856年大破清军的江南江北两座大营,个人声望达到了顶峰。在此期间,杨秀清虽然把持朝政,但客观来说,都是为了太平天国的公事操劳。而在大破江南江北大营后,杨秀清才开始飘飘然,要求洪秀全封他为“万岁”,于是1856年爆发了天京事变,随后杨秀清就被杀死,天国的军政大权又回到洪秀全手中。