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引物二聚体

引物二聚体(引物二聚体和条带怎么区分)

jnlyseo998998 jnlyseo998998 发表于2023-04-20 22:11:11 浏览81 评论0

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本文目录一览:

如何减少和避免引物二聚体

一般情况下,可以通过提高退火温度来降低引物二聚体。如果二聚体非常严重的话,建议重新设计引物。

引物二聚体如果不影响产物的形成,是可以忽略的,但如果二聚体过多,导致引物与模板结合的特异性过差,可以用调整PCR体系的手段来解决,比如增加酶活性,减少引物使用量,添加enhancer等等。

从PCR反应本身出发,建议适当的减少引物量、提高退火温度;如果是基于PCR产物,最好是挖胶回收,把你的目标片段特异的回收。

不会,引物二聚体的产生原因是引物之间存在大量的碱基互补配对的情况,引物在PCR过程已被消耗,放置中不会新增二聚体。在PCR体系中减少引物用量,或者提高退火温度可减少二聚体的产生。

将引物和探针互相进行配对检测,以避免二聚体和发卡结构的形成。 序列选取应在基因的保守区段 避免引物自身或与引物之间形成4个或4个以上连续配对,避免引物自身形成环状发卡结构 典型的引物18到24个核苷长。

如果引物确定了是不同认为消除的,但是你可以设定条件来选择,还有就是自己逐个的检验,直到这几个条件都满足为止。。

有引物二聚体,非特异性扩增带是怎么回事

1、物理原因:变性对PCR扩增来说相当重要,如变性温度低,变性时间短,极有可能出 现假阴性;退火温度过低,可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率退火温度过高影 响引物与模板的结合而降低PCR扩增效率。

2、降低引物和聚合酶的用量,提高退火温度,或者是采用梯度PCR法,测试能够获得最佳结果的温度退火。

3、就是引物并没有与我们设想的片段结合,最后扩增出非目的条带,一般低退火温度会增加非特异性扩增,高退火温度会减少非特异性扩增。

4、DNA长度较小。那很有可能是引物二聚体。出现这个情况,可能的原因有3:1。引物本身不对,不是目的DNA扩增需要的引物。2。DNA回收提纯的问题 3。PCR体系内镁离子浓度问题。。建议排查下各项。

在做PCR时,出现引物二聚体

根本原因应该是RNA纯度不够,导致反转录的cDNA浓度低。

引物设计不合理,两条或一条引物的3`端有互补序列,造成自己配对延伸而扩增。建议重新设计引物,或者降低退火温度、增加模板和引物的量试下,不过能不能扩出来看运气了。

影响不大。探针法没影响,染料掺入法,现在的仪器都自动刷掉那些长度太小的扩增信号。有人说可能对溶解曲线产生影响,不过我做染料掺入法做的少,没试过。

引物二聚体可以在凝胶成像中检测出来吗

1、曝光太强了,你把光圈调小一点,这样曝光会弱一点,就能够去掉背景的白色了。

2、nanodrop可以测引物二聚体 紫外可见分光光度计基本工作原理和红外光谱仪相似,利用一定频率的紫外可见光照射被分析的有机物质,引起分子中价电子的跃迁,它将有选择地被吸收。一组吸收随波长而变化的光谱,反映了试样的特征。

3、引物二聚体的出现是必然的,但这或多或少是个问题。电泳时引物二聚体带的缺失并不意味着没有二聚体,而是其含量低,我们肉眼是看不到的。

怎样消除引物二聚体

1、从PCR反应本身出发,建议适当的减少引物量、提高退火温度;如果是基于PCR产物,最好是挖胶回收,把你的目标片段特异的回收。

2、有时扩增不出来。为了保证实验的重复性和稳定性,需要尽可能减少引物二聚体的发生。一般情况下,可以通过提高退火温度来降低引物二聚体。如果二聚体非常严重的话,建议重新设计引物。

3、pcr产物回收试剂盒能去除引物二聚体,因为有很好的吸附性。引物二聚体在不同领域中有不同意义,但基本涵义都表示相同或同一种类的物质,以成双的型态出现,可能具有单一状态时没有的性质或功能。

4、如果引物确定了是不同认为消除的,但是你可以设定条件来选择,还有就是自己逐个的检验,直到这几个条件都满足为止。。

5、引物二聚体如果不影响产物的形成,是可以忽略的,但如果二聚体过多,导致引物与模板结合的特异性过差,可以用调整PCR体系的手段来解决,比如增加酶活性,减少引物使用量,添加enhancer等等。

什么是引物二聚体,它对PCR反应有什么影响?

1、是在pcr反应中,两条引物上的互补碱基相结合形成的聚合体,这种聚合体出现了,就相当于原本可以扩增的原料链减少了,即会导致扩增的效率降低,所以最好能避免这种物质的出现。

2、引物二聚体是引物的3端间相互错配扩增形成的。引物二聚体的出现是必然的,只是或多或少的问题,电泳时看不到引物二聚体带也不代表没有二聚体出现,只是含量低我们 的肉眼看不到而已。

3、引物二聚体是引物3端不匹配放大形成的。 引物二聚体的出现是必然的,但这或多或少是个问题。电泳时引物二聚体带的缺失并不意味着没有二聚体,而是其含量低,我们肉眼是看不到的。