据“看台海”报道，苏贞昌在年前两度请辞台行政机构负责人，台当局领导人蔡英文办公室表示，在春节假期协调人选。25日，有绿营媒体透露，蔡英文前副手陈建仁已经同意接任台行政机构负责人，蔡办当天下午证实这一消息。
“中研院”院士陈建仁过去在学术表现上，曾有不光彩的历史。据台媒披露，2007年，陈建仁担任“国科会主委”期间，他挂名共同作者的论文投稿到国际知名期刊《Cancer》，被期刊编辑指称涉嫌抄袭，引发轩然大波。中国国民党“立委”赖士葆呼吁陈建仁若要出来当“阁揆”，应先向大众说明此事以及学术标准。
赖士葆也批评，被传要接“副阁揆”的郑文灿，台大论文才因为抄袭被撤销，行政机构正副负责人不就都有抄袭争议？
据悉，陈建仁身为学术伦理主管机关首长，却卷入学术抄袭风波，他以“深感愧疚”为由，向当时行政机构负责人苏贞昌提出书面辞呈，但最后获慰留。
这件事从此成为陈建仁学术生涯的污点，并纠缠他多年，蔡英文2015年找他搭档成为正副领导人候选人时，论文涉嫌抄袭事件又被提出，当时陈建仁对外公开解释说“是抄录不当，不是抄袭”。
陈建仁辩解说，这篇论文是关于肺癌，主要作者是一位陈医师，通讯作者是台大前校长杨泮池，他则是共同作者，投稿到期刊后，审查委员指出“这篇论文有一部分字句是抄录了某篇论文其他部分，而没有改写”，他检视后发现确有抄录不当的地方，因此就跟杨泮池联络后进行修正，最后论文还是发表了，因此并不是抄袭。
针对陈建仁、郑文灿出任行政团队一二把手，两人都涉入抄袭风波。赖士葆此前曾批评，坐实了这个行政团队视学术伦理如无物的荒谬，更酸这是“抄袭内阁”。
