进化论最大的缺陷是什么
进化论最大的缺陷是超自然现象。
在达尔文的《物种起源》当中，他提出了一个理论，认为有机体和器官都是在不断的发展的。并且还提供了一个测试来检验这个理论是一个伪理论：“如果我们可以证明任何复杂器官的存在，他们可能不是经过无数连续的细微修正形成的，我的理论绝对会崩溃。”
而从21世纪经过对细胞和分子生物学的不断深入研究发现，每一个细胞都不能通过达尔文的测试。因为每一个器官要想发挥功效，要依赖于复杂的生物结构。即使是生物大分子本身也具有不能逐渐增加的复杂性。
后来在1851年，他的女儿安妮去世之后，达尔文的信仰就减少了，并且比较倾向怀疑主义了。当他被问及他的宗教取向时，他指出他从来不是无神论，但不可知论是对他的心思更准确的描述。达尔文在自传里亦曾表示，福音书的真确性存疑，他也没有充足证据相信基督教是神的教义。
1951年的时候，一份美国报章第一次发表的作者不详的文章《The Lady Hope Story》，作者提出达尔文老年在病榻时再度信奉基督教，却被达尔文的子孙及历史学家否认。他的女儿表示，达尔文并未再信奉基督教，这只是那些创造论的拥护者为了宣传创造论而使用的一些手段而已。
进化论有什么漏洞
达尔文进化论的主要思想没有漏洞。只能说达尔文进化论有不足的地方。
1，他的自然选择原理是建立在当时流行的“融合遗传”假说之上的。按照融合遗传的概念 ，父、母亲体的遗传物质可以像血液那样发生融合；这样任何新产生的变异经过若干世代的融合就会消失，变异又怎能积累、自然选择又怎能发挥作用呢。
2，达尔文过分强调了生物进化的渐变性；他深信“自然界无跳跃”，用“中间类型绝灭”和“化石记录不全”来解释古生物资料所显示的跳跃性进化。他的这种观点近年正越来越受到间断平衡论者和新灾变论者的猛烈批评。
进化论的不足称之为“缺陷”更合理，进化论的缺陷包括且不限于：
①生殖隔离：目前认为生殖隔离是新物种出现的一种机制，大型生物尤其是大型动物，染色体这样的生物结构数量的变化难以用渐进式的环境影响解释，如果是渐变式的，将有中间物种出现，但依然不能解释染色体数量的变化，染色体的配对现象使得不同具有不同数目染色体的生物很难繁殖出有繁殖能力的后代。
②生命大爆发：地球历史上出现过多次的生物爆发与灭绝，生物的数量和生物体的结构都发生了显著的变化，也在挑战着渐进式的生物进化观，目前提出有间断平衡假说，描述了一个系谱长期所处的静止或平衡状态被短期的、爆发性的大进化所打破，伴随着产生大量新物种。
③中性突变：指对生物的生存状态暂时无害也没有好处的突变基因，有科学家提出了中性突变假说，认为决定生物进化的不是环境因素，而是中性突变的累积，与过去的生物进化理论有所区别。
《进化论》到底有多少漏洞
科学体系容得下科学也可以证伪，在目前的证据链之下，进化论的确存在着不少缺陷，但还不能动摇现代生物进化理论的地位，它仍是有关生物演变的最合理的理论体系。
通过现代生物学理论和古生物学、地质学等研究生命演变进化的历史，自然是十分艰难的，地球生命历史可是有将近40亿年，绝大多数生物都无法在自然界中留下痕迹，只有少数能形成化石，而现代生命科学和对地球的探索范围，无法找到地球所有时期所有物种的化石等证据，就无法将其完整地联系起来，使得对生命的认识上必然有缺陷。
进化论的不足称之为“缺陷”更合理，所谓的缺陷是现有证据链中存在的对生物进化理论有挑战的内容，或者用现代生物学理论不能解释的事情，但是这些内容又不能否定进化论，这一点也是生命科学想要解决的，不管是证实此前的一些假说还是证伪现有的部分理论，都将使进化论更加完善。
进化论的缺陷包括且不限于：
①生殖隔离：目前认为生殖隔离是新物种出现的一种机制，大型生物尤其是大型动物，染色体这样的生物结构数量的变化难以用渐进式的环境影响解释，如果是渐变式的，将有中间物种出现，但依然不能解释染色体数量的变化，染色体的配对现象使得不同具有不同数目染色体的生物很难繁殖出有繁殖能力的后代。
②生命大爆发：地球历史上出现过多次的生物爆发与灭绝，生物的数量和生物体的结构都发生了显著的变化，也在挑战着渐进式的生物进化观，目前提出有间断平衡假说，描述了一个系谱长期所处的静止或平衡状态被短期的、爆发性的大进化所打破，伴随着产生大量新物种。
③中性突变：指对生物的生存状态暂时无害也没有好处的突变基因，有科学家提出了中性突变假说，认为决定生物进化的不是环境因素，而是中性突变的累积，与过去的生物进化理论有所区别。
这些问题对现代生物进化理论既有挑战也能和谐相处，各自能解释一些生物进化问题，因此也有科学家提出了生物的进化四因说，不过这些假说都还不能动摇进化论的地位，生物进化的观点已经确定，目前不明白的是因何进化，怎样进化。
